Kegiatan dan aktifitas harian pendidikan dan pengajaran di Dayah MUDI Mesjid Raya dapat digambarkan sebagai berikut :
Suasana belajar di siang hari.

A. Bagian Pendidikan
  • Belajar
  • Ujian / Evaluasi
  • Ujian Kenaikan Kelas
B. Bagian Ibadah
  • Kegiatan Amaliah Wajib
  • Kegiatan Amaliah Sunnah, meliputi:
                  - Puasa Tasu'a
                  - Puasa 'Asyura
                  - Puasa Rajab (tanggal 1-3, 14-16, dan 27-30)
                  - Puasa Sya'ban (tanggal 1-3 dan 14-16)
               
C. Bagian Gotong Royong
  • Kegiatan Kebersihan Asrama
  • Kegiatan Kebersihan Lingkungan
 D. Bagian Humas
  • Kegiatan Fardhu Kifayah
  • Kegiatan Hari Maulid
  • Kegiatan Pendanaan
  • Kegiatan Sosial
  • Kegiatan Jum`atan
  • Kegiatan di Bidang Badan Dakwah
 E. Bagian Keamanan
  • Kegiatan Kedisplinan Santri
  • Kegiatan Pencegahan kriminalitas
  • Kegiatan Ketertiban Lembaga dan lingkungan
Secara umum kegiatan harian dan rutinitas harian yang dilakukan oleh santri di Dayah MUDI Mesjid Raya dapat dilihat pada tabel di bawah ini:

NO
PUKUL
KEGIATAN
1.                  
05.15 – 06.00
Shalat Subuh secara berjama`ah
2.                  
06.00 – 07.45
Masak, Makan dll
3.                  
07.45 – 10.30
Belajar di kelas
4.                  
10.30 – 11.00
Shalat Dhuha
5.                  
11.00 – 12.30
Istirahat
6.                  
12.30 – 13.45
Shalat Dhuhur secara berjama`ah
7.                  
13.45 – 15.30
Belajar di kelas
8.                  
15.30 – 16.00
Shalat Asar secara berjama`ah
9.                  
16.00 – 18.45
Kegiatan pribadi : Masak, makan, nyuci, dll
10.              
18.30 – 19.30
Shalat Maghrib secara berjama`ah
11.              
19.30 – 21.00
Belajar di kelas
12.              
21.00 – 21.25
Shalat Insya secara berjama`ah
13.              
21.25 – 23.25
Belajar di kelas
14.              
23.25 – 05.25
Istirahat malam