Ma’had Aly adalah lembaga pendidikan tinggi yang fokus pada program studi Islam murni yang diselenggarakan pondok pesantren (dayah). Satu kampus Ma’had Aly menyelenggarakan satu program studi, seperti Sejarah dan Peradaban Islam, Fiqh dan Ushul Fiqh, Tafsir dan Ilmu Tafsir, Aqidah dan Filsafat Islam, Hadits dan Ilmu Hadits, serta Tasawwuf dan Tarekat.

Ma’had Aly mempunyai posisi yang setara dengan perguruan tinggi (PT) lainnya, baik Sekolah Tinggi Agama Islam Negeri (STAIN), Institut Agama Islam Negeri (IAIN), Universitas Islam Negeri (UIN), maupun kampus-kampus pada umumnya. Hanya saja, Ma’had Aly difokuskan pada studi Islam murni. Sementara itu, STAIN, IAIN dan UIN adalah perguruan tinggi yang mengkorelasikan antara ilmu Islam murni dan ilmu umum.

Lembaga Pendidikan Islam Ma’hadal ‘Ulum Diniyah Islamiyah (MUDI) Mesjid Raya Samalanga sejak tanggal 03 Dzulqaidah 1430 H bertepatan 21 Oktober 2009 M telah menyelenggarakan satuan pendidikan Ma’had Aly dengan program studi Fiqh Wa Ushuluh (Aktualisasi Studi Naskah Fiqh dan Ushul Fiqh), guna melahirkan ahli di bidang ilmu agama Islam (Mutafaqqih Fiddin) dan mengembangkan ilmu Islam berbasis kitab kuning. Di samping itu, modernisasi yang mengakibatkan segala persoalan masalah hukum agama yang timbul dalam masyarakat sangat membutuhkan kehadiran ahli yang membidanginya.

VISI, MISI, DAN TUJUAN
Visi Ma’had Aly MUDI adalah sebagai Pusat keunggulan (Center of Excellent) Studi Islam dan kaderisasi Ulama serta Pewaris Tradisi Ilmiyah, amaliyah Ulama Mutaqaddimin wa Muta’akhhiriin. 

Adapun Misi Ma'had Aly MUDI adalah: 
  1. Melaksanakan sistem pendidikan dayah setingkat perguruan tinggi serta melaksanakan kaderisasi ulama dengan membekali dan menanamkan tradisi ilmiyah dan amaliyah guna menumbuhkan kemampuan kader ulama dalam bidang manhaj, metodelogi dan teknologi. 
  2. Menyelenggarakan penelitian dan pendalaman kajian terhadap berbagai literatur dan turats yang muktabar dalam lingkungan ulama mazhab Syafi’i secara utuh dan komprehensif.
  3. Menyediakan sarana dan prasarana untuk kelancaran proses pendidikan dan penelitian. 
Ma’had Aly MUDI Mesjid Raya Samalanga bertujuan :
  1. Mendidik sarjana muslim sejati, beriman teguh, berakhlak mulia, handal, dan menjalankan ajaran Islam dalam kehidupannya, baik sebagai individu maupun sebagai anggota masyarakat. 
  2. Menyiapkan sarjana yang memiliki kemampuan untuk mengembangkan masyarakat Islam serta mampu mengaplikasikan ilmunya di sektor formal maupun non formal.
  3. Mendidik sarjana bidang Fiqh wa ushuluh yang memiliki integritas ke-Islam-an, keilmuan dan kebangsaan sehingga siap mengabdikan diri bagi masyarakat.
  4. Menghasilkan sarjana muslim yang dapat memberi teladan dalam kehidupan masyarakat atas dasar ajaran Islam dan falsafah Bangsa Indonesia. 
KURIKULUM
Rancangan dan isi kurikulum disusun berdasarkan pada Peraturan Menteri Agama (PMA) No. 71 Tahun 2015 tentang Ma’had ‘Aly yang disempurnakan dan kurikulum lokal sebagai pengayaan, remidiasi, dan sebagai ciri khas lembaga. Berdasarkan rancangan dan isi kurikulum tersebut, implementasinya dilakukan melalui sistem kitabi yang mengambarkan ciri khas dan budaya pembelajaran di pesantren. 

SEMESTER PELAJARAN
I Bahasa Indonesia
Bahasa Arab
Bahasa Inggris
Ilmu Nahwu
Ilmu Sharaf
Pengantar Fiqh
Pengantar Ushul Fiqh
Aplikasi Komputer
SEMESTER PELAJARAN
II Fiqh Mu'amalah I
Fiqh Faraidh dan Washiyat
Fiqh Nikah I
Qiyas
Qawaid Fiqhiyyah
Pengantar Metodologi Penelitian
Ayat Ahkam
SEMESTER PELAJARAN
III Dinamika Fiqh dan Ushul Fiqh
Fiqh Thaharah I
Fiqh Shalat I
Fiqh Zakat I
Mabahis al-Aqwal I
Ulumul Qur'an
Ulumul Hadits
Filsafat Hukum Islam
SEMESTER PELAJARAN
IV Fiqh Muamalah II
Fiqh Nikah II
Fiqh Jinayat I
Istidlal
Ta'adul Wa Tarajih
Sirah Nabawiyah
Metodologi Penelitian Hukum
SEMESTER PELAJARAN
V Fiqh Thaharah II
Fiqh Shalat II
Fiqh Zakat II
Mabahis al-Aqwal II
Tarikh Tasyri'
Ilmu Mantiq
Ilmu Balaghah
Penulisan Karya Ilmiah
SEMESTER PELAJARAN
VI Fiqh Jinayat II
Fiqh Qadha'
Ijtihad
Fiqh Muqarran
Praktik Mubahasah wal Muhadharah
Hadits Ahkam
SEMESTER PELAJARAN
VII Fiqh Shalat Jama'ah
Fiqh Puasa
Fiqh Puasa dan Umrah
Al-Sunnah
Ijma'
Maqasid Al-Syar'iyyah
Ilmu Kalam
Ilmu Tasawuf
SEMESTER PELAJARAN
VIII Seminar Proposal
KPM
Risalah

TENAGA PENGAJAR/DOSEN
Sebagai pendukung utama bagi penyiapan lulusan berkualitas maka dibutuhkan sumber daya yang memadai dan berkualifikasi untuk menyelenggarakan proses pembelajaran di Ma’had Aly MUDI Mesjid Raya Program Studi Fiqh wa Ushuluh. Untuk mengampu materi ajar telah tersedia ustaz/dosen dengan kualifikasi pendidikan setara doktoral dan magister di bidang Fiqh wa Ushuluh dan bidang lain yang berkaitan.
DOSEN TETAP DOSEN TAMU
1. Abi H. Zahrul Mubarrak HB, M. Pd
2. Aba H. Sayed Mahyiddin TMS, S. Sos. I
3. Abiya H. Muhammad, S. HI
4. Aba H. Helmi Imran, MA
5. Waled Tarmizi Al-Yusufi
6. Waled Zulfitri, S. HI
7. Abi H. Ismail, S. Sos. I
8. Tgk. Marzuki, M. Pd
9. Tgk. Nazar, S. Sos. I
10. Abaya Muhammad Nasir HS
11. Tgk. H. Sulaiman Hasan, S. HI., Lc
12. Tgk. Muhibbuddin., MA
13. Tgk. Murdani, S. Pd.I
14. Tgk. Masrizal, MA
15. Tgk. Nainunis, MA
16. Tgk. Mukhtar, S. Sos. I
17. Aba Muhammad Nasir Hasbullah
1. Ayah H. M. Amin Daud
2. Ayah Tgk. Dr. Muntasir, MA
3. Abiya Tgk. H. Muhammad Hatta, Lc., M. Ed
4. Dr. M. Adli Abdullah, SH., MCL
5. Dr. Amrizal J. Prang, S. H.,L.LM

PENERIMAAN MAHASANTRI
I. Pendaftaran

Syarat Pendaftaran
  • Lulusan ‘Aliyah Dayah Mudi Mesjid Raya Samalanga dengan melampirkan fotocopy ijazah. 
  • Calon mahasantri masuk katagori 10 besar peringkat kelas ‘Aliyah Dayah MUDI Mesjid Raya Samalanga (dibuktikan dengan surat keterangan Bagian Pendidikan Dayah MUDI Mesjid Raya) 
  • Bersedia memenuhi biaya pendidikan di Ma’had Aly MUDI Mesjid Raya Samalanga 
  • Mendaftarkan diri dan mengembalikan formulir pendaftaran pada Panitia Penerimaan Mahasantri Baru dan membayar biaya pendaftaran Rp. 100.000,- 
  • Bersedia mengikuti aturan Ma’had Aly MUDI Mesjid Raya Samalanga.
Prosedur Pendaftaran Mahasantri Baru
  • Mengisi formulir pendaftaran yang disediakan Panitia. 
  • Melampirkan Pendaftaran dengan : 
                = Pas foto berwarna ukuran 3x4 (6 lembar) dengan ketentuan latar biru, berpeci hitam dan baju putih.
               = Fotocopy ijazah yang telah dilegalisir.
               = Fotocopy KTP.

Tempat dan Waktu Pendaftaran
  • Calon Mahasantri baru dapat mendaftarkan diri ke kantor Ma’had Aly MUDI Mesjid Raya Samalanga setiap jam kerja. 
  • Jadwal pendaftaran dimulai pada tanggal 15 s/d 20 Syawal 1439 H. 
II. Ujian Seleksi
Setiap calon mahasantri baru wajib mengikuti 3 tahap seleksi:
  • Ujian seleksi (Subtantif Fiqh dan Ushul Fiqh) pada hari senin tanggal 23 Syawal 1439 H pukul 08.00 WIB s/d 09.30 WIB. 
  • Uji penguasaan kitab kuning pada hari rabu tanggal 25 Syawal 1439 H pukul 08.00 s/d 11.30 WIB. 
  • Wawancara pada tanggal 25 Syawal 1438 H , pukul 08.00 s/d 11.30 WIB. 
          Catatan: Calon mahasantri akan diuji penguasaan kitab kuning oleh penguji yang di SK-kan Langsung oleh pengurus Ma’had Aly MUDI Mesjid Raya Samalanga.

III. Tata Tertib Ujian
  • Berpakaian rapi dan sopan. 
  • Setiap peserta ujian sudah harus berada di tempat ujian paling lambat 15 menit sebelum ujian dimulai. 
  • Toleransi keterlambatan adalah 5 menit. Tidak diadakan perpanjangan waktu. 
  • Peserta ujian yang terlambat melampaui 5 menit, tidak diperkenankan mengikuti tes di ruang tes, tetapi harus segera melapor ke Ketua panitia di Sekretariat panitia untuk keputusan lebih lanjut. 
  • Selama ujian berlangsung peserta ujian dilarang menggunakan alat komunikasi. 
  • Hasil ujian masuk diumumkan tiga hari setelah ujian seleksi dilaksanakan.
III. Pendaftaran Ulang
  • Pendaftaran ulang pada tanggal 29 s/d 30 Syawal 1439 H 
  • Melunasi biaya yang berkaitan dengan Ma’had Aly